分析:A、由一种元素组成的纯净物属于单质;
B、分子、原子、离子是构成物质的三种基本微粒;
C、含有碳元素的化合物属于有机化合物;
D、电离时生成的阴离子都是氢氧根离子的化合物属于碱
解答:解:A、金刚石、石墨都是由碳元素组成的纯净物,属于碳元素组成的单质,正确;
B、分子、原子都是构成物质的微粒,正确;
C、甲烷、乙醇都是含有碳元素的化合物,属于有机化合物,正确;
D、烧碱是氢氧化钠的俗称,属于碱;纯碱是碳酸钠的俗称,属于盐,错误.
故选D.
点评:本题主要考查物质的分类方面的知识,解答时要紧紧围绕概念的含义进行分析、判断,从而得出正确的结论.